Google Antigravity finder ny peptidkandidat
Googles agentplatform samlede databasessøgning i én session og udpegede et kandidat-peptid mod luftvejsinfektioner, som nu testes.
Antigravity udpegede en ny peptidkandidat
Med Google Antigravity har biologer fremfundet et hidtil ukendt kandidat-peptid, der forudsagt virker mod de bakterier, der forårsager luftvejsinfektioner. Kandidaten er nu sendt til validering i vådlab, altså de fysiske laboratorietests, hvor en forudsigelse enten holder eller falder.
Baggrunden er presset: antimikrobiel resistens anslås at kunne koste 10 millioner dødsfald om året globalt i 2050, og nye antibiotika kommer sjældent ud.
Søgningen blev samlet i én session
Google Antigravity er Googles platform for autonome udviklingsagenter, der kan planlægge og udføre opgaver selvstændigt. Her fungerer den som et videnskabeligt arbejdsbord, hvor biologer kan finde, strukturere og prioritere lovende mål hurtigt.
Det, der før var en opslittet jagt over flere databaser, sker nu samlet. Platformen gennemgik millioner af hidtil ukarakteriserede proteiner i UniProt-databasen ved hjælp af modellen ProtNLM.
ProtNLM læser proteiners evolutionære grammatik
ProtNLM (Protein Natural Language Model) er en dyb læringsmodel, der forudsiger biologisk funktion direkte ud fra en aminosyresekvens. Den er trænet til at læse den evolutionære grammatik, altså de mønstre, evolutionen har bygget ind i sekvenserne over tid.
Det er nødvendigt, for meget af UniProt er mørkt stof: sekvenser uden beskrevet funktion, fordi de ikke ligner kendte proteiner. ProtNLM sætter labels på dem med proteinnavn, funktionskommentarer, celleplacering og GO-termer, et fælles ordforråd for genfunktioner.
Kandidaten mangler stadig laboratoriebevis
Fundet er en forudsigelse, ikke et resultat. Først når vådlabs-testene viser, at peptidet faktisk hæmmer de relevante patogener, er der tale om et dokumenteret fund.
Netop bakteriociner, en type antimikrobielle peptider, er lovende, fordi de evolutionært er formede til at ramme bakteriers grundlæggende svagheder fra cellehinder til indre maskineri. Det gør det sværere for patogener at udvikle resistens.
Flere detaljer
- Nisin, Darobactin, Dynobactin og Lariocidin er allerede udpegede bakteriociner.
- ProtNLM beriger navnløse UniProt-poster med høj-sikre funktionslabels.
- Artiklen er en teknisk gennemgang fra Google DeepMind.
Kilder:
Google DeepMind →
Genfortalt i egne ord af AI-nyheder.com · AI-genereret illustration · Tjek altid originalkilden, før du handler på vigtige oplysninger.